مادربرد H97M-E دارای فرم فاکتور MicroATX است. این فرم فاکتور راهنمای خوبی در انتخاب یک کیس مناسب برای مادربردمان خواهد بود. H97M-E مجهز به چیپ‌ست H97 شرکت اینتل است. این چیپ‌ست توانایی پشتیبانی از پردازنده‌های Core i7 / i5 / i3 / Pentium / Celeron LGA1150 را دارد و از قابلیت RAID برای بالابردن امنیت نگه‌داری از داده‌ها پشتیبانی می‌کند. این قابلیت امکان بگاپ‌گیری و تامین فضای مورد نیاز برای نگه‌داری داده‌های شما را با استفاده از الگوریتم‌های تعریف شده‌اش مهیا می‌کند. مادربرد H97M-E از نسخه‌های RAID 0 , RAID 1 , RAID 10 , RAID 5 قابلیت پشتیبانی دارد. چهار عدد اسلات DDR3 برای نگه‌داری از حافظه‌های رم روی مادربرد قرار گرفته است. ایسوس برای بالا بردن بازدهی این مدل قابلیت دوکاناله بودن را برای H97M-E قرار داده است و شما قادر به ارتقای حافظه خود تا 32 گیگابایت خواهید بود. برای استفاده از کارت گرافیکی یک اسلات PCI Express X16 در قسمت بالایی کنترلر چیپ‌ست پردازنده قرار گرفته است. برای اتصال کارت‌های توسعه از سه عدد PCI Express X1 می‌توانید بهره‌مند شوید. کانکتور SATA3.0 به تعداد چهار عدد روی مادربرد به چشم می‌خورد. برای استفاده از درایوهای نوری و هارددیسک‌ها از طریق این کانکتور می‌توانید ارتباط خود را مهیا سازید. در پنل پشتی یک عدد درگاه USB3.0 برای انتقال داده با سرعت 5 گیگابیت بر ثانیه در کنار سه عدد USB2.0 قرا گرفته است. برای برقراری اتصال بین نمایشگر و مادربرد در پنل پشتی چند رابط به چشم می‌خورد. یک پورت VGA، یک پورت DVI و یک پورت HDMI رابط‌های انتقالی برای تصویر هستند. با اتصال به پورت LAN کارت شبکه 8111GR شرکت Realtek قابلیت انتقال سرعت 10/100/1000 مگابیت بر ثانیه را به شما هدیه می‌دهد. همانند کارت شبکه کارت صدا هم تولید شرکت Realtek است و مدل ALC887 دارای 8 کانال صوتی و 3 جک 3.5 میلی‌‎متری برای اتصال ابزار صوتی است. این مادربرد به پورت خروجی صدای S/PDIF مجهز بوده که قابلیت انتقال صوت از طریق نور را به شما می‌دهد. ایسوس قابلیت پشتیبانی از فناوری طراحی Q-Design و EZ DIY خود را روی این محصول قرار داده است.